疾病管制署今（13日）表示，目前仍值呼吸道傳染病好發季節，加上尾牙聚會活動及臨近春節連假，國內外旅遊頻繁，疾病傳播風險高，尤其長者及慢性病患等高風險對象影響甚鉅。疾管署自2026年1月1日起，公費新冠疫苗已擴大提供全國滿6個月以上尚未接種之民眾接種，直至2月28日止。現行提供接種之莫德納LP.8.1及NovavaxJN.1疫苗均安全有效，對於目前新冠病毒主流變異株都具保護效果，呼籲尚未接種新冠疫苗者，把握1月1日至2月28日擴大接種期間，儘速前往接種，及早提升保護力。截至今年1月12日，公費流感疫苗接種數約664.8萬人次，全國疫苗尚餘約17.9萬劑；新冠疫苗接種累計約159.8萬人次，其中Novavax疫苗接種約4.1萬人次。
依據疾管署監測資料顯示，今年第1週（1/4–1/10）類流感門急診就診計91,842人次，較前1週上升9.6%；另近7日（1/6–1/12）新增23例流感併發重症病例（3例H1N1、19例H3N2、1例B型）及3例死亡（均為H3N2）。依實驗室監測資料顯示，目前社區中流行之呼吸道病原體以流感病毒為主，其中以A型H3N2為多，其次為B型及A型H1N1。本（2025–2026）流感季累計441例重症病例（118例H1N1、317例H3N2、1例A型未分型、5例B型）及86例死亡（24例H1N1、60例H3N2、1例A型未分型、1例B型），其中重症病例以65歲以上長者（占64%）及具慢性病史者（占83%）為多，88%未接種本季流感疫苗。全球活動度上升，鄰近國家日本、韓國近3週呈下降趨勢，惟仍處流行期；西亞／東南亞、歐洲、北非、北／中美洲及加勒比海地區陽性率高且流感活動上升，全球主要流行型別為A（H3N2），惟南美洲以A（H1N1）pdm09為主。
疾管署說明，國內新冠疫情目前處低點波動，第1週新冠門急診就診計1,081人次，較前一週上升23.8%，近期趨勢持平，主流變異株為NB.1.8.1；上週新增4例新冠併發重症本土病例，無新增本土病例死亡。2025年10月起累計53例新冠併發重症本土病例，其中6例死亡，重症病例以65歲以上長者（占64%）及具慢性病史者（占83%）為多，94%未接種本季新冠疫苗。全球近期新冠病毒陽性率下降，鄰近國家／地區中國、香港、日本、韓國疫情皆略為上升，惟整體仍處低點；美國疫情亦持續上升，另德國疫情呈下降趨勢。目前全球流行變異株以XFG占比最高，其次為NB.1.8.1，鄰近國家／地區如中國、香港、日本及韓國以NB.1.8.1占比為高。
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