今年受到疫情爆發影響，全台灣各級學校從五月中旬開始停課，學生們可說是放了一個最長的暑假。但這也造成學生學習上的困難、以及需要上班的家長們得另找方法與時間照顧孩子的困擾。在防疫警戒降為二級之後，台北市政府決定從今(1)日起全面開學。突然爆增的人流讓台北市長柯文哲擔心增加感染機會，但由於已在開學前積極要求各校做好使用隔板等各種防護措施，因此仍採取實體上課的方式。
台北市高中職以下各級學校在9月1日正式開學，台北市長柯文哲在教育局長曾金燦的陪同下到北市延平國小視察開學與上課狀況。柯文哲坦言，台北市高中職以下學生共約28萬人，突然增加的人潮與人流恐會同步增加感染機率，因此要求學校上課要用隔板，並且保持教室通風、要求進學校要量體溫和全程戴口罩。此外，也禁止家長及訪客入校，只能送孩子到校門口，再由教師協助帶領進入校園。
雖然已經看過台北市學校所準備的整套防疫物資和系統，但柯文哲仍要求得格外謹慎小心，特別是特教學校、幼兒員、國小和國中。台北市政府也對各級學校公告了「校園防疫指引SOP」。柯文哲前(30)日於防疫記者會上表示，9月1日開學後，原則上大型的集會活動如校外教學、校際串聯都暫不解封，採線上辦理，觀察到9月30日再說。他認為目前學校應是相當安全的，但尊重學生不到校上課的選擇，不過防疫假以二週為原則，不會列入出勤紀錄。
至於教師的部分，柯文哲表示，目前台北市教師接種疫苗的比例已超過9成。如果還沒施打者，應該在開學前儘快打完。不過對於選擇特定疫苗或者不願接種疫苗的老師，基本上尊重當事人的選擇，但必須每週做快篩。
柯文哲今天也在臉書上發文對同學喊話：「各位同學，未來不管疫情如何翻轉、再也沒有理由不上課了，請認命，趕快收心吧！不要等我Morning Call」
以下為台北市政府所公布的各級校園防疫指引：
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